孤岛惊魂2的故事发生在非洲，在某个不知名的小国中爆发了内战，玩家作为一名外地来的雇佣兵接了一个大单，这个订单告诉我们有一名叫杰克的军火贩子，在这次的内战中推波助澜大发战争财，你的任务就是要干掉它。这种又正义又赚钱的买卖谁不爱呢？于是主角动身前往城区打探杰克的消息，没想到一路上却得了疟疾，头晕眼花的主角刚刚在城区旅馆躺下休息一番，却被一个人惊醒了。
这个站在自己身边，手里正把玩着自己随身携带的任务简报的人看着有点眼熟，不就是自己追寻的目标杰克吗？很显然，杰克被主角这种千里送人头的行为打动了。在与病的话都说不出口的主角热情的单方面交换了一些意见后，还不忘记给主角带了两样伴手礼。
被气晕的主角再次醒来后听到的却是城区里的枪炮声，内战中的两大对立组织撕破了停火协议，正在城区内火拼。主角尝试杀出重围却寡不敌众，被绳之以法，再次昏倒。
主角第三次醒来，这次出现在我们眼前的是内战双方组织其中一方的干部，它在查阅了我们的身份后，发现主角并不是敌人。本着敌人的敌人就是朋友，敌人的陌生人也能凑合当朋友的心态，主角光荣的成为了一名内战打工人，开启了游走在这场内战多方势力中寻找杰克线索的故事。
整个孤岛惊魂2的故事讲起来很简洁，但是熟悉育碧的玩家应该都知道，育碧明明是一家法国公司，却很少讲那些欧美主旋律，反而对黑深残和搞反差有些执念。
比如3代从拯救女友到手刃女友、4代玩家惊呼反派竟是我自己等等，这种剧情风格的起源你同样可以在孤岛惊魂2中见到。不过剧情做的再好也只是一部分，真判定好不好玩还得看玩法。
这款游戏乍一看不像是一款主打爽快的主流fps游戏，反而处处凸显着拟真和硬核的气息。整个游戏画面里的ui少的可怜，但这简陋的ui背后开发团队却在这个世界的交互设计方面下足了功夫，让游戏过程充满了制作精良和代入感拉满的细节。
比如当我们前往目标地点时，没有常见的按下M键就能一览无余甚至能够给玩家用AR视角呈现出路径的地图系统，取而代之的则是一张张纸质地图和车上屏幕小的可怜的GPS导航。当玩家走出这张地图时，主角就会从包里掏出另一张地图继续引导。
